步驟:
1. 菌株擴增及質粒提取
明舟提供包含質粒的菌株,使用LB進行菌群擴增,每株菌種擴增20ml
pAdTrack-HPV16-L1(virus)-Neo,添加1%的Kan
pLV-EF1a-DsRed-IRES-BSD,添加1%的Amp
psPAX2,添加1%的Amp
pMD2.G,添加1%的Amp
將擴增后的菌種使用質粒小提試劑盒提取5ml質粒,其他菌種保存為甘油菌,置于-80冰箱凍存。
紫外分光光度計測定質粒濃度
2. 片段PCR
PCR體系:pAdTrack-HPV16-L1(virus)-Neo:1μl;
2 × Phanta Max Master Mix (Dye Plus):25μl;
MluI HPV-L1 F:1.5μl;
NheI rHPV-L1 R:1.5μl;
H2O:補齊至50μl;
共100μl
程序:
預變性:94℃,2min
變性:98℃,10s
退火:56℃,30s
延伸:68℃,20s
終延伸:68℃,5min
共計30個循環。
配置0.8%的瓊脂糖凝膠進行電泳,使用FastPure Gel DNA Extraction Mini Kit回收PCR產物,使用紫外分光光度計計算產物濃度
3. 酶切
由于Miu I及Nhe I Buffer不通用,因此分段進行酶切
片段體系1:
Nhe I :1μl;
Nhe I Buffer:2μl
PCR產物:1μg;
H2O:補齊至20μl。
共20μl,37℃酶切1h
片段體系2:
Miu I :1μl;
Miu I Buffer:5μl
片段體系1:20μl;
H2O:補齊至50μl。
共50μl,37℃酶切1h
載體體系1:
Nhe I:1μl
Nhe I Buffer:2μl
pLV-EF1a-DsRed-IRES-BSD:1μg
H2O:補齊至20μl。
共20μl,37℃酶切1h
載體體系2:
Miu I :1μl;
Miu I Buffer:5μl
載體體系1:20μl;
H2O:補齊至50μl。
共50μl,37℃酶切1h
配置0.8%的瓊脂糖凝膠進行電泳,使用FastPure Gel DNA Extraction Mini Kit回收酶切產物,使用紫外分光光度計計算產物濃度
4. 連接
連接體系:
T4 DNA Ligase:1μl
T4 Buffer:1μl
酶切片段體系2產物:5μl
酶切載體體系2產物:3μl
共10μl,配置20μl
置于金屬浴16℃連接過夜
5. 轉化
將兩支Stbl3大腸化轉感受態從-80冰箱取出,置于冰上融化。向Stbl3大腸化轉感受態,加入連接產物,每支10μl,置于冰上30min。42℃熱激活30s。置于冰上5min。向Stbl3大腸化轉感受態加入1ml無抗LB,37℃,250rpm,激活1h。離心菌株,取含1%AMP的LB瓊脂平板,向平板滴加菌液并涂布均勻。置于37℃培養過夜。
6. 菌株篩選
菌板挑取9個菌落,分別置于1ml AMP LB中擴增,同時進行菌落PCR
菌落PCR體系:
2 × Taq Master Mix (Dye Plus):10μl
MluI HPV-L1 F:1μl
NheI rHPV-L1 R:1μl
H2O:補齊至20μl
共20μl,配置200μl(10支)
配置0.8%的瓊脂糖凝膠進行電泳,挑選陽性菌株。
7. 測序鑒定
將篩選為陽性的菌液進行送測鑒定
8. 菌株擴增
將測序結果正確的菌株使用20mlLB進行擴增,取15ml菌液提取質粒,剩余菌液凍存至-80
9. 細胞準備
提前準備培養HEK 293T細胞,在轉染前一天將細胞傳代至6CM平板,數量約為150萬/板,細胞生長正常即可使用。
10. PEI轉染
(1) DNA稀釋液的準備
對一個6cm平板,取試管加入100μl細胞培養液(無血清、雙抗)及4μg質粒,按照質量比
pLV-HPV-L1-EF1a-DsRed-IRES-BSD:psPAX2:pMD2.G=4:3:1,
即pLV-HPV-L1-EF1a-DsRed-IRES-BSD:2μg,psPAX2:1.5μg,pMD2.G:0.5μg。
根據測定的質粒濃度
即pLV-HPV-L1-EF1a-DsRed-IRES-BSD:6.8μl,psPAX2:5.3μl,pMD2.G:2.5μl
使用移液器輕輕吹打混勻。
(2)轉染試劑的準備
對一個6cm平板,取試管加入84μl細胞培養液(無血清、雙抗)及16μl PEI,使用移液器輕輕吹打混勻。
(3)轉染復合物的準備
將配置好的轉染試劑加入配置好的DNA稀釋液中,使用移液器輕輕吹打混勻,室溫孵育20min。
(4)細胞轉染
將6cm平板培養上清棄去,加入5ml新鮮的培養液(無血清、雙抗)。將轉染復合物均勻滴加到平皿中,培養6h。
培養6h后,每個平皿補加5%的血清,繼續培養48h。
共轉染6cm平板4個,共需要LV-HPV-L1-EF1a-DsRed-IRES-BSD:27.2μl,psPAX2:21.2μl,pMD2.G:10μl,DMEM:341.6μl
PEI:64μl,DMEM:336μl
11. 病毒收集
將轉染后的細胞繼續培養48-72h。收集細胞上清,500g離心10min,收集上清。使用除菌濾器過濾收集上清。
12. 病毒滴度檢測
使用慢病毒滴度檢測試劑盒,檢測慢病毒滴度。
13. 病毒感染
培養HEK 293細胞,6孔板,鋪HET293細胞1板,每孔細胞約為5x105;鋪293T細胞1板,每孔細胞約為3x105。
培養過夜,細胞匯合度約50%。感染時,棄去原本培養基,向每孔加入培養基1ml,隨后分別向孔內滴加0、50、100、200、400μl病毒上清。感染后4h,更換新鮮培養基至2ml。
48h后,除陰性孔外,每孔更換含10%病毒上清的新鮮完全培養基,繼續在溫箱中進行培養。
14. 穩轉細胞篩選
病毒感染后48h,可使用熒光顯微鏡紅光模式觀察細胞感染情況。
將感染較多的孔,擴增至48孔板,在縱列建立滅瘟素S殺傷梯度曲線,其濃度從上至下分別為:0μg/ml,2.5μg/ml,5μg/ml,10μg/ml,20μg/ml,40μg/ml,共計6個梯度。同時建立陰性細胞殺傷曲線。
每3日更換一次培養基,直至10d左右,觀察陰性曲線及實驗組殺傷情況,若陰性曲線細胞死亡不足,則適當延長培養時間。
15. 單克隆細胞株的篩選
收集在高濃度BSD中生長的細胞,并擴增3代,凍存細胞后將細胞進行有限稀釋度法篩選單克隆細胞。
結果:
1. 質粒提取
pAdTrack-HPV16-L1(virus)-Neo及pLV-EF1a-DsRed-IRES-BSD擴增,共擴增20ml。
收獲質粒:
pAdTrack-HPV16-L1(virus)-Neo 60μl,濃度93.4ng/μl。
pLV-EF1a-DsRed-IRES-BSD 60μl,濃度277.7ng/μl
2. 片段擴增

F1. HPV16-L1片段PCR電泳
片段PCR產物電泳可見,產物大小約為1500bp,與預期結果1518bp接近,確認片段擴增成功。回收后片段濃度為455ng/μl
3. 酶切回收

F2. HPV16-L1片段及pLV-EF1a-BSD,Miu I、Nhe I雙酶切后電泳
酶切后可見片段及載體已經酶切完全,片段位置與預期大小相符,回收后載體濃度為11.3ng/μl,片段濃度為13.3ng/μl。
4. 轉化與陽性菌落篩選

F3. 酶切片段連接后轉化的菌板
轉化感受態并涂板,過夜培養后可見細菌生長良好。挑取9株菌株進行1ml擴增,并同時進行菌落PCR。

F4. 菌落PCR檢測電泳圖
菌落PCR檢測可見,所有菌株均有條帶,但條帶大小不一致。懷疑可能為PCR產物過多,且電泳電壓太大導致。將2/4/5/8/9號菌株送測,同時將L1 PCR擴增回收產物送測
經測序檢測,9號菌株測序結果正常無突變。
5. 三質粒系統提取
擴增9號及兩個包裝質粒,檢測顯示,三質粒濃度分別為9#:292ng/μl,pMD 2.G:204ng/μl,psPAX2:283ng/μl
6. 收毒
收取轉染后病毒上清,使用慢病毒檢測卡檢測慢病毒滴度

F5. 慢病毒滴度檢測試劑卡檢測轉染細胞上清

F6. 慢病毒滴度檢測試劑卡檢測空白上清

F7. 慢病毒滴度比色卡
經比對,確認慢病毒顆粒數約為3x109/ml,感染粒子濃度約為3x106/ml