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慢病毒構建步驟

 

 步驟:

 

1. 菌株擴增及質粒提取

 明舟提供包含質粒的菌株,使用LB進行菌群擴增,每株菌種擴增20ml

pAdTrack-HPV16-L1(virus)-Neo,添加1%Kan

pLV-EF1a-DsRed-IRES-BSD,添加1%Amp

psPAX2,添加1%Amp

pMD2.G,添加1%Amp

 

將擴增后的菌種使用質粒小提試劑盒提取5ml質粒,其他菌種保存為甘油菌,置于-80冰箱凍存。

紫外分光光度計測定質粒濃度

 

2. 片段PCR

PCR體系:pAdTrack-HPV16-L1(virus)-Neo1μl

2 × Phanta Max Master Mix (Dye Plus)25μl

MluI HPV-L1 F1.5μl

NheI rHPV-L1 R1.5μl

H2O:補齊至50μl

100μl

 

程序:

預變性:94℃2min

變性:98℃10s

退火:56℃30s

延伸:68℃20s

終延伸:68℃5min

共計30個循環。

 

配置0.8%的瓊脂糖凝膠進行電泳,使用FastPure Gel DNA Extraction Mini Kit回收PCR產物,使用紫外分光光度計計算產物濃度

 

3. 酶切

由于Miu INhe I Buffer不通用,因此分段進行酶切

 

片段體系1

Nhe I 1μl

Nhe I Buffer2μl

PCR產物:1μg

H2O:補齊至20μl

20μl37℃酶切1h

 

片段體系2

Miu I 1μl

Miu I Buffer5μl

片段體系120μl

H2O:補齊至50μl

50μl37℃酶切1h

 

載體體系1

Nhe I1μl

Nhe I Buffer2μl

pLV-EF1a-DsRed-IRES-BSD1μg

H2O:補齊至20μl

20μl37℃酶切1h

 

載體體系2

Miu I 1μl

Miu I Buffer5μl

載體體系120μl

H2O:補齊至50μl

50μl37℃酶切1h

 

配置0.8%的瓊脂糖凝膠進行電泳,使用FastPure Gel DNA Extraction Mini Kit回收酶切產物,使用紫外分光光度計計算產物濃度

 

4. 連接

連接體系:

T4 DNA Ligase1μl

T4 Buffer1μl

酶切片段體系2產物:5μl

酶切載體體系2產物:3μl

10μl,配置20μl

 

置于金屬浴16℃連接過夜

 

5. 轉化

將兩支Stbl3大腸化轉感受態從-80冰箱取出,置于冰上融化。向Stbl3大腸化轉感受態加入連接產物,每支10μl,置于冰上30min42℃熱激活30s。置于冰上5min。向Stbl3大腸化轉感受態加入1ml無抗LB37℃250rpm,激活1h。離心菌株,取含1%AMPLB瓊脂平板,向平板滴加菌液并涂布均勻。置于37℃培養過夜。

 

6. 菌株篩選

菌板挑取9個菌落,分別置于1ml AMP LB中擴增,同時進行菌落PCR

 

菌落PCR體系:

2 × Taq Master Mix (Dye Plus)10μl

MluI HPV-L1 F1μl

NheI rHPV-L1 R1μl

H2O:補齊至20μl

20μl,配置200μl10支)

 

配置0.8%的瓊脂糖凝膠進行電泳,挑選陽性菌株。

 

7. 測序鑒定

將篩選為陽性的菌液進行送測鑒定

 

8. 菌株擴增

將測序結果正確的菌株使用20mlLB進行擴增,取15ml菌液提取質粒,剩余菌液凍存至-80

 

9. 細胞準備

提前準備培養HEK 293T細胞,在轉染前一天將細胞傳代至6CM平板,數量約為150/板,細胞生長正常即可使用。

 

10. PEI轉染

(1) DNA稀釋液的準備

對一個6cm平板,取試管加入100μl細胞培養液(無血清、雙抗)及4μg質粒,按照質量比

pLV-HPV-L1-EF1a-DsRed-IRES-BSDpsPAX2pMD2.G=4:3:1

pLV-HPV-L1-EF1a-DsRed-IRES-BSD2μgpsPAX21.5μgpMD2.G0.5μg

根據測定的質粒濃度

pLV-HPV-L1-EF1a-DsRed-IRES-BSD6.8μlpsPAX25.3μlpMD2.G2.5μl

使用移液器輕輕吹打混勻。

(2)轉染試劑的準備

對一個6cm平板,取試管加入84μl細胞培養液(無血清、雙抗)及16μl PEI,使用移液器輕輕吹打混勻。

(3)轉染復合物的準備

將配置好的轉染試劑加入配置好的DNA稀釋液中,使用移液器輕輕吹打混勻,室溫孵育20min

(4)細胞轉染

6cm平板培養上清棄去,加入5ml新鮮的培養液(無血清、雙抗)。將轉染復合物均勻滴加到平皿中,培養6h

培養6h后,每個平皿補加5%的血清,繼續培養48h

共轉染6cm平板4個,共需要LV-HPV-L1-EF1a-DsRed-IRES-BSD27.2μlpsPAX221.2μlpMD2.G10μlDMEM341.6μl

PEI64μlDMEM336μl

 

11. 病毒收集

將轉染后的細胞繼續培養48-72h。收集細胞上清,500g離心10min,收集上清。使用除菌濾器過濾收集上清。

 

12. 病毒滴度檢測

使用慢病毒滴度檢測試劑盒,檢測慢病毒滴度。

 

13. 病毒感染

培養HEK 293細胞,6孔板,鋪HET293細胞1板,每孔細胞約為5x105;鋪293T細胞1板,每孔細胞約為3x105

培養過夜,細胞匯合度約50%。感染時,棄去原本培養基,向每孔加入培養基1ml,隨后分別向孔內滴加050100200400μl病毒上清。感染后4h,更換新鮮培養基至2ml

48h后,除陰性孔外,每孔更換含10%病毒上清的新鮮完全培養基,繼續在溫箱中進行培養。

 

14. 穩轉細胞篩選

病毒感染后48h,可使用熒光顯微鏡紅光模式觀察細胞感染情況。

將感染較多的孔,擴增至48孔板,在縱列建立滅瘟素S殺傷梯度曲線,其濃度從上至下分別為:0μg/ml2.5μg/ml5μg/ml10μg/ml20μg/ml40μg/ml,共計6個梯度。同時建立陰性細胞殺傷曲線。

3日更換一次培養基,直至10d左右,觀察陰性曲線及實驗組殺傷情況,若陰性曲線細胞死亡不足,則適當延長培養時間。

 

15. 單克隆細胞株的篩選

收集在高濃度BSD中生長的細胞,并擴增3代,凍存細胞后將細胞進行有限稀釋度法篩選單克隆細胞。

 

結果:

 

1. 質粒提取

pAdTrack-HPV16-L1(virus)-NeopLV-EF1a-DsRed-IRES-BSD擴增,共擴增20ml

收獲質粒:

pAdTrack-HPV16-L1(virus)-Neo 60μl,濃度93.4ng/μl

pLV-EF1a-DsRed-IRES-BSD 60μl,濃度277.7ng/μl

 

2. 片段擴增

 


         F1. HPV16-L1片段PCR電泳

 

片段PCR產物電泳可見,產物大小約為1500bp,與預期結果1518bp接近,確認片段擴增成功。回收后片段濃度為455ng/μl

 

3. 酶切回收

 

 

F2. HPV16-L1片段及pLV-EF1a-BSDMiu INhe I雙酶切后電泳

 

酶切后可見片段及載體已經酶切完全,片段位置與預期大小相符,回收后載體濃度為11.3ng/μl,片段濃度為13.3ng/μl

 

4. 轉化與陽性菌落篩選

 

      

      

 

F3. 酶切片段連接后轉化的菌板

 

轉化感受態并涂板,過夜培養后可見細菌生長良好。挑取9株菌株進行1ml擴增,并同時進行菌落PCR

 

       

F4. 菌落PCR檢測電泳圖

 

菌落PCR檢測可見,所有菌株均有條帶,但條帶大小不一致。懷疑可能為PCR產物過多,且電泳電壓太大導致。將2/4/5/8/9號菌株送測,同時將L1 PCR擴增回收產物送測

 

經測序檢測,9號菌株測序結果正常無突變。

 

5. 三質粒系統提取

擴增9號及兩個包裝質粒,檢測顯示,三質粒濃度分別為9#292ng/μlpMD 2.G204ng/μlpsPAX2283ng/μl

 

6. 收毒

收取轉染后病毒上清,使用慢病毒檢測卡檢測慢病毒滴度


 

F5. 慢病毒滴度檢測試劑卡檢測轉染細胞上清

 


 

 

F6. 慢病毒滴度檢測試劑卡檢測空白上清

 


 

 

         F7. 慢病毒滴度比色卡

經比對,確認慢病毒顆粒數約為3x109/ml,感染粒子濃度約為3x106/ml