以釀酒酵母為研究對(duì)象，依托全基因組代謝模型（GEM） 計(jì)算設(shè)計(jì)通用型代謝底盤菌株。

核心原理為模塊化代謝分流重構(gòu)：通過算法預(yù)測(cè)兩類改造靶點(diǎn)，一是敲除競(jìng)爭(zhēng)代謝基因?qū)崿F(xiàn)產(chǎn)物與菌體生長(zhǎng)耦合，二是過表達(dá)前體、輔因子供給基因強(qiáng)化目標(biāo)碳流。依據(jù)產(chǎn)物前體共性將 29 類產(chǎn)物分組，配套對(duì)應(yīng)標(biāo)準(zhǔn)化改造方案，僅需少量基因操作即可快速適配不同產(chǎn)物合成。

該模型導(dǎo)向策略省去大量試錯(cuò)實(shí)驗(yàn)，構(gòu)建出具備優(yōu)良全局代謝表型、可二次改造合成多種化學(xué)品的酵母底盤，為通用微生物細(xì)胞工廠提供設(shè)計(jì)模板。

           氮饑餓下 α- 酮戊二酸抑制 PTS 葡萄糖轉(zhuǎn)運(yùn)系統(tǒng)及改造菌株生長(zhǎng)性能表征

文獻(xiàn)來源

Chubukov V, Desmarais JJ, Wang G, Chan LJG, Baidoo EE, Petzold CJ, Keasling JD, Mukhopadhyay A. Engineering glucose metabolism of Escherichia coli under nitrogen starvation. NPJ Syst Biol Appl. 2017 Jan 5;3:16035. doi: 10.1038/npjsba.2016.35. PMID: 28725483; PMCID: PMC5516864.

文獻(xiàn)鏈接：https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC5516864/