以釀酒酵母為研究對象,依托全基因組代謝模型(GEM) 計算設計通用型代謝底盤菌株。
核心原理為模塊化代謝分流重構:通過算法預測兩類改造靶點,一是敲除競爭代謝基因實現產物與菌體生長耦合,二是過表達前體、輔因子供給基因強化目標碳流。依據產物前體共性將 29 類產物分組,配套對應標準化改造方案,僅需少量基因操作即可快速適配不同產物合成。
該模型導向策略省去大量試錯實驗,構建出具備優良全局代謝表型、可二次改造合成多種化學品的酵母底盤,為通用微生物細胞工廠提供設計模板。
氮饑餓下 α- 酮戊二酸抑制 PTS 葡萄糖轉運系統及改造菌株生長性能表征
文獻來源
Chubukov V, Desmarais JJ, Wang G, Chan LJG, Baidoo EE, Petzold CJ, Keasling JD, Mukhopadhyay A. Engineering glucose metabolism of Escherichia coli under nitrogen starvation. NPJ Syst Biol Appl. 2017 Jan 5;3:16035. doi: 10.1038/npjsba.2016.35. PMID: 28725483; PMCID: PMC5516864.